公司可以扣發員工的年終獎嗎，當一年開始將近尾聲，不少人已經開始對年終獎關心起來，不同的用人單位對於發放年終獎也會有所不同，但是有不少人會問公司可以扣發員工的年終獎嗎？現在爲您詳細介紹。
原勞動部《關於貫徹執行勞動法若干問題的意見》明確規定，工資是指用人單位依據國家有關規定或勞動合同約定，以貨幣形式直接支付給本單位勞動者的勞動報酬，一般包括計時工資、計件工資、獎金、津貼和補貼、延長工作時間的工資報酬以及特殊情況下支付的工資等。
由此可以看出，年終獎是單位根據全年經濟效益和對員工全年工作業績的綜合考覈情況而發放的一次性獎金，不論其以什麼形式出現，如月度獎、季度獎或年終獎等，始終不能改變其屬於工資這一根本屬性。年終獎屬於合法勞動報酬的範疇，而不是用人單位激勵員工、留住人員的手段。
因此，在公司不能舉證證明年終獎不屬於法律規定的工資的`情況下，應當認定這裏的年終獎屬於基本工資的補充，
如果公司以合同約定爲由拒絕向辭職的員工發放年終獎，這裏涉及到的法律問題是《勞動合同法》第26條第1款第2項規定。該規定指出，在勞動合同中，用人單位免除自己的法定責任，排除勞動者權利的條款應屬於無效條款。
就勞動關係雙方當事人的權利義務而言，勞動者向用人單位提供勞動，用人單位支付工資是各自主要的義務。而公司以上述約定免除自己的法定責任，排除勞動者權利的約定，違反了法律的相關規定，與《勞動法》中用人單位不得剋扣或者無故拖欠勞動者的工資的規定相沖突，同時也限制了勞動者合法取得勞動報酬的權利，應屬無效條款。
因此，關於年終獎支付問題，在勞資雙方未約定的情況下，無論勞動者是否在年終獎發放前離職，用人單位均應支付。如果雙方對此有約定，應考察該約定是否爲用人單位免除自己的法定責任，排除勞動者權利的約定。如是，則應認定爲無效，用人單位還應支付年終獎。
年終獎個稅計算方法一、年終獎個稅計算方式
年終獎計稅方法共有2種，分別爲：
1。扣除三險一金後，如果當月工資超過3500元，全年一次性獎金除以12，按照得出的數額找到對應稅率，然後直接套入年終獎的計算公式，得出應繳稅額。
2。扣除三險一金後，如果當月工資收入不足3500元，則先從年終獎中拿出一部分錢，將當月工資補足3500元后，然後將剩餘的年終獎金額套入計算公式，得出應繳稅額。
舉例說明：
如果發放年終獎的當月工資爲2434元(扣除三險一金後)，年終獎爲4500元，那麼首先從年終獎中減去1066元補足當月工資，然後將3434元除以12得出286元，對應的稅率爲3%，那麼年終獎扣稅額爲3434×3%-0=103元。
如果發放年終獎的當月工資爲4000元(扣除三險一金後)，發放年終獎爲4500元，那麼先將4500元除以12得出375元，適用稅率爲3%，那麼年終獎扣稅額爲4500×3%-0=135元。
二、新個稅下年終獎個稅怎麼算
1、年終獎金應納稅額
年度獎金的個人所得稅適用的稅率：年終獎金總額/12後再對應適用稅率
年終獎應納稅額=年終獎金總額×年終獎適用稅率-速算扣除數
2、工資個稅的計算公式
應納稅額=(工資薪金所得 -“五險一金”-扣除數)×適用稅率-速算扣除數
3、個稅免徵額是3500，使用超額累進稅率的計算方法
繳稅=全月應納稅所得額*稅率-速算扣除數
實發工資=應發工資-四金-繳稅。
全月應納稅所得額=(應發工資-四金)-3500。
