(一)治療
採用綜合治療措施，包括及時處理各種緊急情況，如脫水、酸中毒、電解質紊亂，休克，低血糖的處理。調整飲食，去除病因，改善消化功能及處理併發症等。
緊急情況的處理
對輕到中度脫水可先用口服補液療法(ORT)，既補充電解質，也補充部分熱能。近來世界衛生組織推薦另一種口服補液鹽-來索美(Resomal)，此種口服補液鹽適當降低了鈉鹽含量，提高了鉀鹽及其他成分。嚴重脫水則採用靜脈補液，補液時需注意以下幾點：
(1)消瘦兒脫水程度的估計：消瘦兒的脫水程度常易估計過高，故補液總量按體重計算宜偏低，以免加重心臟負擔，引起心力衰竭。
(2)消瘦兒脫水性質的估計：由於消瘦兒脫水多呈低滲性，補入液體中鈉鹽含量應適當提高，電解質與非電解質之比可增至2∶1。
(3)電解質的補充：重度營養不良兒常伴有缺鉀、缺鈣及酸中毒，在糾正脫水後期開始排尿時應及時補鉀，出現酸中毒時應給予5%碳酸氫鈉加以糾正，有低鈣表現時及時補鈣。輸液量一般按50～80ml/kg計算。
2.調整飲食補充營養
可根據營養不良的程度、消化功能和對食物的耐受力逐步調整營養。
(1)調整的原則：由少到多，由稀到幹，由單一到多樣化，直到小兒恢復到正常進食，營養改善爲止。
(2)熱量及蛋白質的計算：輕度營養不良由於小兒的消化功能及對食物的耐受力接近正常，可基本維持原膳食不變，熱卡由502 kJ/(kg·d)[ 120kcal/(kg·d)]逐漸加至585kJ/(kg·d)[ 140kcal/(kg·d)]。
中至重度營養不良，其消化功能及食物耐受力均差，食慾亦低下，熱卡計算應從251.0kJ/(kg·d)[ 60kcal/(kg·d)]逐漸增加至502kJ/(kg·d) [120kcal/(kg·d)]乃至711.0kJ/(kg·d)[ 170kcal/(kg·d)]。
蛋白質攝入量從1.5～2.0g/(kg·d)開始，逐漸增加至3.0～4.5g/(kg·d)。過早給予高蛋白食物可引起腹脹和肝大。
(3)食物的選擇：補充能量和優質蛋白，嬰兒應鼓勵繼續母乳餵養。如已斷奶應給予牛乳或其他乳製品如配方奶、脫脂奶，視患兒病情輕重，食慾好壞，消化代謝情況而定。一般患兒消化功能均較差，任何飲食都應從少量開始，如無不良反應，可逐步增加。餵養的原則爲在脫水糾正後，給予少量多次稀釋奶，在以後幾天內逐步增加牛奶的濃度及量，但宜減少餵奶次數。在病程6～8天時可按每公斤每天150ml分6次餵給。不吃牛奶的小兒，可選擇米湯、稀米粥逐步過渡到粥，奶糕，半脫脂奶或豆漿。晚期可給予高能量的食物如全奶、魚、蛋、豆漿、肝末、肉末、魚粉、魚泥及少量植物油。有條件可用酪蛋白、水解蛋白或人工合成氨基酸混合液。從治療一開始就應當補充維生素，特別是維生素A、鋅、鐵及葉酸等。
近來世界衛生組織推薦了一種“F-100”的治療奶方，即在早期食療奶中加植物油、維生素及微量元素組成的混合奶，用以治療嚴重營養不良所致的微量元素失衡，每100g奶可提供100kcal熱量，能最大限度的地增加體重，使兒童營養狀況得以較快的恢復。
3.糾正貧血
營養不良兒常伴有中、重度貧血，血紅蛋白多在80g/L以下，當伴有寄生蟲感染時貧血可更爲嚴重。當血紅蛋白低於80g/L時可靜脈輸注壓積紅細胞，其量可按5～10ml/kg輸注，同時口服鐵劑、葉酸及維生素B12等。
4.促進消化改善代謝
給予各種消化酶以助消化，口服各種維生素或應用蛋白同化類固醇如苯丙酸諾龍，每次肌注0.5～1.0mg/kg，每週1～2次，連續2～3周，對食慾差者可用胰島素2～3U肌注，1次/d，注射前口服20～30g葡萄糖，每1～2周爲一療程。病情嚴重者可酌情選用葡萄糖、氨基酸、脂肪乳等靜脈注射。伴明顯低蛋白可靜脈注射人血白蛋白。鋅製劑可提高味覺敏感度、增加食慾，每天補充元素鋅0.5～1.0mg/kg。治療開始後由於明顯的或隱匿性水腫的消退，最初幾周內其體重可繼續丟失。當血漿及腸道酶的活性逐步恢復後，腸道吸收脂肪及蛋白質的功能乃得以改善。
5.積極治療併發症
當合並細菌感染時，應積極查明病竈並給予相應的抗生素治療。寄生蟲感染可於恢復期治療。
6.中醫中藥治療
中醫稱營養不良爲“疳積”，是小兒四大疾病“痘、麻、疳、驚”之一。其治療以健脾補氣、理中化積爲主。主要採用參苓白朮散加減，此外捏脊、推拿、鍼灸及割治等民間廣爲應用，亦有一定療效，尤其適用於農村缺醫少藥的地方。
7.精心護理
營養不良患兒精神多抑鬱，少言寡歡。病室應創造良好的氣氛，醫護人員態度應和藹、親切、多給患兒撫愛。居室陽光宜充足，空氣新鮮，清潔並衛生。臥牀患兒尤應精心護理及餵養，防止嘔吐及嗆咳。對食慾差者不可強迫餵養。長期臥牀者應勤翻身以免發生褥瘡。對低體溫者注意保暖。治療期間每週測體重一次，每月測身高一次。
(二)預後
患者的預後取決於營養不良的程度，發病的時間，有無合併症以及治療是否得當。疾病發病癒早，程度愈重且合併感染者預後越差。胎兒期營養不良其後果可延續到嬰兒期乃至終身;不僅影響到體格生長還可影響到日後小兒的認知及行爲。本病預後相對比惡性營養不良爲好，住院病死率約在1%～2%。年長兒稍高，恢復較慢。嬰幼兒時期患營養不良性消瘦，若持續數月以上，可留下遠期不良後果，如身材矮小和大腦生長髮育受影響。
