豆製品固然養分豐富，色香味俱佳，但也並非人人咸宜，患有以下疾病者都應當忌食或者少吃。
１、消化性潰瘍：嚴重消化性潰瘍病人不要食用黃豆、蠶豆、豆腐絲、豆腐乾等豆製品，由於其中嘌呤含量高，有增進胃液分泌的作用；整粒豆中的膳食纖維還會對胃黏膜造成機械性損傷。豆類所含的低聚糖如水蘇糖和棉子糖，固然不能被消化酶分解而消化吸收，但可被腸道細菌發酵，能分解發生一些小分子的氣體，進而引起打嗝、腸叫、腹脹、腹痛等症狀。
２、胃炎：急性胃炎和慢性淺表性胃炎病人也不要食用豆製品，以免刺激胃酸分泌和引起胃腸脹氣。
３、腎臟疾病：腎炎、腎功能衰竭和腎臟透析病人應採用低蛋白飲食，爲了保證身體的基礎須要，應在限量範圍內選用適量含必須氨基酸豐富而含非必須氨基酸又低的食品，與動物性蛋白質相比，豆類含非必須氨基酸較高，故應禁食。
４、糖尿病腎病：引起糖尿病患者逝世亡的重要併發症是糖尿病腎病，當病人有尿素氮瀦留時，也不宜食用豆製品。
５、傷冷病：儘管長期高熱的傷冷病人應攝取高熱量高蛋白飲食，但在急性期和恢復期，爲預防呈現腹脹，不宜飲用豆漿，以免產氣。
６、急性胰腺炎：急性胰腺炎發作時，可飲用高碳水化合物的清流質，但忌用能刺激胃液和胰液分泌的豆漿等。
７、痛風：痛風的發病機理是嘌呤代謝混亂，以高尿酸血癥爲重要特點。該病多見於充裕家庭中，高蛋白高脂肪膳食輕易引起痛風。食品蛋白質多與核酸結合成核蛋白，其中核酸分解爲嘌呤，繼而分解爲尿酸。因此在急性期要禁用含嘌呤多的食品，其中包含幹豆類及豆製品，即使在緩解期也要有限制地食用。
８、半乳糖及乳糖不耐受症：由於這些病人體內缺少與半乳糖和乳糖分解、代謝有關的酶，在飲食上應忌食含乳糖的食品。豆類食品中的水蘇糖和棉子糖在腸道分解後可發生一部分半乳糖，所以，病情嚴重者應禁用豆製品。
９、苯丙酮酸尿症：這是兒童常見的一種先天性代謝缺點病。對這種病的治療方法重要是依靠食用特製的低苯丙氨酸食品來控制血液中苯丙氨酸的濃度，同時留意禁食或少用富含蛋白質的豆製品和動物性食品等。
