治便祕，古代名醫名方今猶在。張仲景《傷寒雜病論》載有“蜜煎導方”：蜂蜜煎稠，冷卻成膏，捻成尖頭細條，徐徐捻進肛門，蜜條受熱融化，便可通。華佗有潤腸丸傳世，如今藥店有售。孫思邈《千金要方》載有“神仙一把抓”，通便迅速。李時珍《本草綱目》載有二方：一方爲楝實、茴香、牽牛，治他外甥的便祕；一方爲皁角、牽牛，治一位皇親國戚的便祕。此四人，或醫聖，或神醫，其方靈驗，毋庸置疑。
還有更多的古代名醫名方傳世，廣爲應用，皆靈驗。古人講養生，養生忌便祕，故而有古人養生格言：“欲得長生，腸中常清；欲得不死，腸中無滯。”現在便祕者常用的通便藥、下瀉藥多爲古方或由古方改造而來。但是，古往今來的通便藥、下瀉藥，都是治標不治本，如果標本兼治，現在哪會有這麼多便祕者。
便祕之本，是腸道細菌。腸道細菌與便祕的關係，是近幾十年來，隨着腸道微生態學的發展才認識到的。由於時代的侷限性、科學的侷限性，古代醫聖、神醫、名醫不可能留下針對細菌的藥方。腸道之內，生長着400種、100萬億個、1公斤重的細菌，細菌屬於微生物，所以它們在腸道內的生存狀態叫腸道微生態。腸道里的細菌有好有壞，好細菌以雙歧桿菌爲代表，壞細菌以大腸桿菌爲代表，兩大陣營互相競爭，而常以雙歧桿菌佔優勢，因此，大多數人在大多數情況下腸道是健康的。雙歧桿菌好處多多，不必細說，僅就排便而言，好處有三：雙歧桿菌密密麻麻地定植在腸道內壁上，生生不息地生長繁殖，腸道內壁表面細胞因此更具活力，腸道蠕動因此而添動力；雙歧桿菌的生長繁殖需要充足的水分，若腸道內的水分不足，便吸收腸壁外的水分進來，進入腸內的水分在滋養雙歧桿菌的同時也滋潤乾結的糞便，以利糞便排出；雙歧桿菌喜歡酸性環境，沒有酸性環境就營造酸性環境，因而在生長繁殖過程中分泌大量有機酸，這些有機酸比水分更加滋潤乾結的糞便。那麼，只要腸道內雙歧桿菌數量足夠，佔據優勢，就不可能發生便祕，反之，就有可能。
其他原因導致便祕以後，便祕也會影響雙歧桿菌的生長繁殖，原因是，糞便久滯，會產生鹼性毒素，形成鹼性環境，這將抑制雙歧桿菌生長繁殖，而利於大腸桿菌生長繁殖，大腸桿菌佔了優勢，進一步抑制雙歧桿菌，這就會出現惡性循環。
